MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42f

Total Repeats: 13053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007766	AT	3	6	705	710	50 %	50 %	0 %	0 %	86360735
2	NC_007766	CGA	2	6	791	796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360735
3	NC_007766	TCG	2	6	827	832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360735
4	NC_007766	CG	4	8	831	838	0 %	0 %	50 %	50 %	86360735
5	NC_007766	TCG	3	9	857	865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360735
6	NC_007766	CGGCC	2	10	894	903	0 %	0 %	40 %	60 %	86360735
7	NC_007766	CG	3	6	923	928	0 %	0 %	50 %	50 %	86360735
8	NC_007766	GCC	2	6	943	948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360735
9	NC_007766	CGT	2	6	1023	1028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360735
10	NC_007766	CGT	2	6	1098	1103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360735
11	NC_007766	GA	3	6	1148	1153	50 %	0 %	50 %	0 %	86360735
12	NC_007766	CAG	2	6	1162	1167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360735
13	NC_007766	GTC	2	6	1168	1173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360735
14	NC_007766	TGG	2	6	1187	1192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360735
15	NC_007766	GTC	2	6	1260	1265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360735
16	NC_007766	GGA	2	6	1287	1292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360735
17	NC_007766	GCG	2	6	1293	1298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360735
18	NC_007766	CG	3	6	1297	1302	0 %	0 %	50 %	50 %	86360735
19	NC_007766	CGA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360735
20	NC_007766	GTC	2	6	1429	1434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360735
21	NC_007766	ACG	2	6	1450	1455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360735
22	NC_007766	CGG	2	6	1476	1481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360735
23	NC_007766	GTCG	2	8	1482	1489	0 %	25 %	50 %	25 %	86360735
24	NC_007766	ACA	2	6	1550	1555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360735
25	NC_007766	CGG	2	6	1563	1568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360735
26	NC_007766	CGC	2	6	1630	1635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360736
27	NC_007766	GGC	2	6	1656	1661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360736
28	NC_007766	CGA	2	6	1712	1717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360736
29	NC_007766	CTG	3	9	1728	1736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360736
30	NC_007766	GAC	2	6	1775	1780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360736
31	NC_007766	ATG	2	6	1800	1805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360736
32	NC_007766	GCG	2	6	1831	1836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360736
33	NC_007766	CGT	3	9	1850	1858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360736
34	NC_007766	GGC	2	6	1959	1964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360736
35	NC_007766	GAG	2	6	1965	1970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360736
36	NC_007766	GCA	2	6	2039	2044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360736
37	NC_007766	CGG	2	6	2057	2062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360736
38	NC_007766	CGG	2	6	2126	2131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360736
39	NC_007766	CGT	2	6	2147	2152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360736
40	NC_007766	CG	4	8	2177	2184	0 %	0 %	50 %	50 %	86360736
41	NC_007766	CATCGG	2	12	2213	2224	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86360736
42	NC_007766	CCG	2	6	2230	2235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360736
43	NC_007766	ACG	2	6	2314	2319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360736
44	NC_007766	CGC	2	6	2348	2353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360736
45	NC_007766	CGC	2	6	2505	2510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360737
46	NC_007766	CTG	2	6	2515	2520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360737
47	NC_007766	CCG	2	6	2532	2537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360737
48	NC_007766	CCT	2	6	2559	2564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360737
49	NC_007766	GCG	2	6	2625	2630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360737
50	NC_007766	CGGG	2	8	2767	2774	0 %	0 %	75 %	25 %	86360737
51	NC_007766	AGC	4	12	2831	2842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360737
52	NC_007766	CGA	2	6	2967	2972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360737
53	NC_007766	GCA	2	6	3087	3092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360737
54	NC_007766	TCG	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360737
55	NC_007766	GAT	2	6	3112	3117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360737
56	NC_007766	CG	3	6	3147	3152	0 %	0 %	50 %	50 %	86360737
57	NC_007766	TCG	2	6	3176	3181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360737
58	NC_007766	GC	3	6	3185	3190	0 %	0 %	50 %	50 %	86360737
59	NC_007766	GCGCT	2	10	3251	3260	0 %	20 %	40 %	40 %	86360737
60	NC_007766	CGG	2	6	3339	3344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360737
61	NC_007766	CAA	2	6	3606	3611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360738
62	NC_007766	CG	3	6	3614	3619	0 %	0 %	50 %	50 %	86360738
63	NC_007766	TGG	2	6	3637	3642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360738
64	NC_007766	TTC	2	6	3665	3670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360738
65	NC_007766	AAG	2	6	3730	3735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360738
66	NC_007766	TGA	2	6	3773	3778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360738
67	NC_007766	TGG	2	6	3793	3798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360738
68	NC_007766	GGC	2	6	3820	3825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
69	NC_007766	GCG	3	9	3881	3889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
70	NC_007766	CAG	2	6	3901	3906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360738
71	NC_007766	CCG	2	6	3957	3962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360738
72	NC_007766	CGG	2	6	4077	4082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
73	NC_007766	CGA	2	6	4143	4148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360738
74	NC_007766	GCG	2	6	4157	4162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
75	NC_007766	GC	3	6	4258	4263	0 %	0 %	50 %	50 %	86360738
76	NC_007766	ACG	2	6	4298	4303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360738
77	NC_007766	CGG	2	6	4326	4331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
78	NC_007766	GGC	2	6	4393	4398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
79	NC_007766	CCG	2	6	4466	4471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360738
80	NC_007766	ACT	2	6	4514	4519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360738
81	NC_007766	CCGG	2	8	4564	4571	0 %	0 %	50 %	50 %	86360738
82	NC_007766	GGCG	2	8	4583	4590	0 %	0 %	75 %	25 %	86360738
83	NC_007766	GAA	2	6	4632	4637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360738
84	NC_007766	CGA	2	6	4646	4651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360738
85	NC_007766	CGATC	2	10	4680	4689	20 %	20 %	20 %	40 %	86360738
86	NC_007766	A	6	6	4694	4699	100 %	0 %	0 %	0 %	86360738
87	NC_007766	CGC	2	6	4705	4710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360738
88	NC_007766	CCG	2	6	4850	4855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360738
89	NC_007766	TCG	2	6	4868	4873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360738
90	NC_007766	GCCTCG	2	12	4954	4965	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	86360738
91	NC_007766	GCG	3	9	4988	4996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
92	NC_007766	GC	4	8	5003	5010	0 %	0 %	50 %	50 %	86360738
93	NC_007766	CGC	2	6	5106	5111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360738
94	NC_007766	AAG	2	6	5125	5130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360738
95	NC_007766	TCGC	2	8	5134	5141	0 %	25 %	25 %	50 %	86360738
96	NC_007766	GCC	2	6	5164	5169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360738
97	NC_007766	GGC	3	9	5181	5189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
98	NC_007766	CGG	2	6	5193	5198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
99	NC_007766	CATT	2	8	5263	5270	25 %	50 %	0 %	25 %	86360738
100	NC_007766	CGC	2	6	5273	5278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360738
101	NC_007766	GAA	2	6	5344	5349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360738
102	NC_007766	TCG	2	6	5354	5359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360738
103	NC_007766	TCG	2	6	5405	5410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360738
104	NC_007766	ACGA	2	8	5479	5486	50 %	0 %	25 %	25 %	86360738
105	NC_007766	T	6	6	5488	5493	0 %	100 %	0 %	0 %	86360738
106	NC_007766	AAGG	2	8	5539	5546	50 %	0 %	50 %	0 %	86360738
107	NC_007766	GCC	2	6	5578	5583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360738
108	NC_007766	CTCGCA	2	12	5619	5630	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	86360738
109	NC_007766	GC	3	6	5634	5639	0 %	0 %	50 %	50 %	86360738
110	NC_007766	TCG	2	6	5693	5698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360738
111	NC_007766	ATTGG	2	10	6106	6115	20 %	40 %	40 %	0 %	86360739
112	NC_007766	ATC	2	6	6130	6135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360739
113	NC_007766	GCG	2	6	6136	6141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360739
114	NC_007766	CGT	2	6	6150	6155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360739
115	NC_007766	GAT	2	6	6156	6161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360739
116	NC_007766	GGC	2	6	6174	6179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360739
117	NC_007766	CGGC	2	8	6195	6202	0 %	0 %	50 %	50 %	86360739
118	NC_007766	GGTC	2	8	6285	6292	0 %	25 %	50 %	25 %	86360739
119	NC_007766	CGG	2	6	6330	6335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360739
120	NC_007766	TGG	2	6	6341	6346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360739
121	NC_007766	TGAACG	2	12	6383	6394	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	86360739
122	NC_007766	ATC	2	6	6454	6459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360739
123	NC_007766	GCG	2	6	6552	6557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360739
124	NC_007766	CAG	2	6	6609	6614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360739
125	NC_007766	GCT	2	6	6618	6623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360739
126	NC_007766	GGA	2	6	6636	6641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360739
127	NC_007766	GGCG	2	8	6663	6670	0 %	0 %	75 %	25 %	86360739
128	NC_007766	GGA	2	6	6827	6832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360740
129	NC_007766	GAA	2	6	6907	6912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360740
130	NC_007766	CT	3	6	6934	6939	0 %	50 %	0 %	50 %	86360740
131	NC_007766	GCC	2	6	6950	6955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360740
132	NC_007766	GCG	2	6	6959	6964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360740
133	NC_007766	CG	3	6	7039	7044	0 %	0 %	50 %	50 %	86360740
134	NC_007766	CAG	2	6	7102	7107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360740
135	NC_007766	ATC	2	6	7114	7119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360740
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261	NC_007766	GC	3	6	13005	13010	0 %	0 %	50 %	50 %	86360747
262	NC_007766	CGG	2	6	13067	13072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360747
263	NC_007766	CGAT	2	8	13087	13094	25 %	25 %	25 %	25 %	86360747
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266	NC_007766	CGA	2	6	13223	13228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360747
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392	NC_007766	CGG	2	6	19269	19274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360753
393	NC_007766	CGG	2	6	19306	19311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360753
394	NC_007766	GTTCA	2	10	19533	19542	20 %	40 %	20 %	20 %	86360754
395	NC_007766	CG	4	8	19576	19583	0 %	0 %	50 %	50 %	86360754
396	NC_007766	CGT	3	9	19604	19612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360754
397	NC_007766	CGA	2	6	19657	19662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360754
398	NC_007766	GAC	2	6	19670	19675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360754
399	NC_007766	CCAGAT	2	12	19682	19693	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	86360754
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401	NC_007766	CGT	2	6	19732	19737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360754
402	NC_007766	GGC	2	6	19781	19786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360754
403	NC_007766	CG	3	6	19833	19838	0 %	0 %	50 %	50 %	86360754
404	NC_007766	ACG	3	9	19881	19889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360754
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427	NC_007766	ATC	2	6	21454	21459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360755
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500	NC_007766	GCACGA	2	12	27078	27089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360760

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